新世代基因體定序核心設施
新世代基因體定序核心設施是2008年生多中心自設設施，為支持國家型生質能研究計劃的菌種定序而成立，之後在當時核酸定序使用者委員會的推動下，於 103 年 5 月納入本院共用儀器設施，開放服務全院同仁，並於2019年加入全院性核心設施計畫。
Next Generation Sequencing 為目前全球廣泛使用的高通量定序技術，以二代PCR放大訊號或三代單分子訊號進行大量平行定序，快速產出大量的 fastq 序列檔案。
本核心設施現有二代Illumina高準確度短片段定序儀，高通量HiSeq2500和NextSet2000，以及微生物總體基因體定序MiSeq的機型。也有長片段的三代單分子定序儀PacBio Sequel以及Oxford Nanopore GridION平台。此外，我們近期建立了10x Genomics單細胞平台和最新的空間轉錄體定序，拓展多元化的應用。
我們提供專精的NGS實驗規劃和客製化的NGS樣品建庫和定序，服務學術應用和科研需求。
首先，請到我們的網站了解我們的服務範疇及相關資訊(http://ngs.biodiv.tw/NGSCore/)，並於LIMS系統上請申請PI帳戶。進行線上NGS服務申請後，我們將與您聯繫，安排送件相關流程。
設施位址： 跨領域科技研究大樓 A603
管理人員： 生多中心研究技師 呂美曄 博士
業務承辦： 生多中心約聘助理 李政怡 小姐、陳怡樺 小姐
連絡電話： 2787-1198
設施網址： http://ngs.biodiv.tw/NGSCore/
服務對象： 院內同仁、院外學術機構、民間企業研發人員
服務範疇： 送測者DNA/RNA 樣品之品質測試 (QC)、Library construction、Library QC、qPCR normalization、Next Generation Sequencing，並提供NGS諮詢服務
主要設備：
- Illumina HiSeq 2500 高通量基因體分析系統
- Illumina MiSeq基因體多功能分析系統
- Illumina NextSeq 2000高通量基因體定序系統
- PacBio Sequel system 三代定序儀
- Oxford Nanopore GridION MK1三代單分子高通量基因體定序系統
- 10x Genomics Chromium單細胞解析系統
- Agilent BioAnalyzer 生化分析儀
- Agilent Fragment Analyzer 生化分析儀
- Agilent FEMTO Pulse Automated Pulsed-Field
- CE Instrument Pulse 超微量自動化脈衝場毛細管電泳分析儀
- M220 聚焦超聲儀
- Sage Science BluePippin and ELF 全自動DNA片段回收系統
新世代基因體定序核心設施